UMIN試験ID | UMIN000058129 |
---|---|
受付番号 | R000066443 |
科学的試験名 | マイコバクテリウムの包括的同定における培養法と非培養法との比較:単一施設前向き研究 |
一般公開日(本登録希望日) | 2025/06/10 |
最終更新日 | 2025/06/09 16:54:55 |
日本語
マイコバクテリウムの包括的同定における培養法と非培養法との比較:単一施設前向き研究
英語
Comparison of culture and culture-free methods for comprehensive identification of mycobacteria: a single center prospective study
日本語
非培養法による抗酸菌検出の精度評価
英語
Effectiveness of Culture-Free Methods for Detecting Mycobacteria
日本語
マイコバクテリウムの包括的同定における培養法と非培養法との比較:単一施設前向き研究
英語
Comparison of culture and culture-free methods for comprehensive identification of mycobacteria: a single center prospective study
日本語
非培養法による抗酸菌検出の精度評価
英語
Effectiveness of Culture-Free Methods for Detecting Mycobacteria
日本/Japan |
日本語
肺非結核性抗酸菌感染症
英語
Non-tuberculous mycobacteria pulmonary disease
呼吸器内科学/Pneumology |
悪性腫瘍以外/Others
いいえ/NO
日本語
喀痰から直接、マイコバクテリウムの亜種レベル同定を行うための新規非培養法の診断性能を評価すること。
英語
This study aimed to evaluate the diagnostic performance of a novel culture-free method for subspecies-level identification of mycobacteria directly from sputum.
有効性/Efficacy
日本語
英語
日本語
培養法と比較した非培養法による抗酸菌の亜種レベル同定精度
英語
Accuracy of culture-free methods for subspecies-Level identification of mycobacteria compared to culture methods
日本語
英語
観察/Observational
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
18 | 歳/years-old | 以上/<= |
適用なし/Not applicable |
男女両方/Male and Female
日本語
大阪刀根山医療センターで診断目的に喀痰検体を提出した患者のうち、非結核性抗酸菌(NTM)肺疾患が疑われるか、すでに診断されている患者、または非NTM性の呼吸器疾患を有する患者。
英語
Patients were eligible if they had suspected or confirmed nontuberculous mycobacterial (NTM) pulmonary disease, or if they had other non-NTM respiratory diseases and provided sputum samples for diagnostic evaluation at Osaka Toneyama Medical Center.
日本語
なし
英語
None
125
日本語
名 | 和樹 |
ミドルネーム | |
姓 | 橋本 |
英語
名 | Kazuki |
ミドルネーム | |
姓 | Hashimoto |
日本語
大阪刀根山医療センター
英語
Osaka Toneyama Medical Center
日本語
呼吸器内科
英語
Department of Respiratory Medicine
560-8552
日本語
大阪府豊中市刀根山5-1-1
英語
Osaka Toneyama Medical Center, 5-1-1 Toneyama, Toyonaka, Osaka 560-8552, Japan
06-6853-2001
k.hashimoto@imed3.med.osaka-u.ac.jp
日本語
名 | 和樹 |
ミドルネーム | |
姓 | 橋本 |
英語
名 | Kazuki |
ミドルネーム | |
姓 | Hashimoto |
日本語
大阪刀根山医療センター
英語
Osaka Toneyama Medical Center
日本語
呼吸器内科
英語
Department of Respiratory Medicine
560-8552
日本語
大阪府豊中市刀根山5-1-1
英語
Osaka Toneyama Medical Center, 5-1-1 Toneyama, Toyonaka, Osaka 560-8552, Japan
06-6879-3831
k.hashimoto@imed3.med.osaka-u.ac.jp
日本語
独立行政法人国立病院機構大阪刀根山医療センター(臨床研究部)
英語
Osaka Toneyama Medical Center
日本語
日本語
日本語
英語
日本語
無し
英語
None
日本語
日本語
その他/Other
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
大阪刀根山医療センター
英語
Osaka Toneyama Medical Center
日本語
大阪府豊中市刀根山5-1-1
英語
5-1-1 Toneyama, Toyonaka, Osaka 560-8552, Japan
06-6853-2001
410-chiken@mail.hosp.go.jp
いいえ/NO
日本語
英語
日本語
英語
2025 | 年 | 06 | 月 | 10 | 日 |
未公表/Unpublished
125
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
試験終了/Completed
2023 | 年 | 03 | 月 | 01 | 日 |
2020 | 年 | 07 | 月 | 17 | 日 |
2023 | 年 | 03 | 月 | 01 | 日 |
2024 | 年 | 12 | 月 | 31 | 日 |
日本語
目的:
結核菌(Mycobacterium tuberculosis)および200種以上の非結核性抗酸菌(NTM)を含むMycobacterium属は、菌種や亜種のレベルで臨床転帰や薬剤感受性に大きなばらつきがある。現在も培養法が菌種同定のゴールドスタンダードとされているが、抗酸菌は増殖が遅く、診断や治療の開始が遅れる原因となる。本研究では、喀痰から直接亜種レベルの抗酸菌同定を行う新たな非培養法の診断性能を評価することを目的とした。
方法:
本研究は大阪刀根山医療センターで実施された単一施設の前向きコホート研究であり、非結核性抗酸菌肺疾患が疑われるまたは診断されている115名の患者および非NTM性呼吸器疾患の10名から得られた計125検体の喀痰を対象とした。喀痰検体は、N-アセチル-L-システイン・水酸化ナトリウム(NALC-NaOH)またはコハク酸によって前処理された。培養および全ゲノム解析による従来の標準的ワークフローと、喀痰から直接ターゲットキャプチャーシーケンスを行う非培養法ワークフローを比較した。いずれの手法でも、core genome MLST によってMycobacterium tuberculosis を含む380種以上の抗酸菌の中から亜種レベルでの同定を行った。
結果:
NTM患者115名の検体では、57検体が塗抹陽性、93検体が培養陽性であった。同定された菌種には、M. avium subsp. hominissuisが48株、M. intracellulare subsp. intracellulareが22株、同subsp. chimaeraが5株、M. abscessus subsp. abscessusが7株、同subsp. massilienseが5株、M. tuberculosisが1株、その他のNTMが5株含まれていた。非培養法による同定率は塗抹陽性検体で75.4%(43/57)と高かったが、塗抹陰性検体では13.9%(5/36)と低かった。また、前処理法による違いも見られ、NALC-NaOHによる処理では90.5%(19/21)の高精度であったのに対し、コハク酸処理では66.7%(24/36)であった。
結論:
本前向き研究において、非培養法による亜種レベルの抗酸菌同定は、特にアルカリ処理された塗抹陽性喀痰検体において90%以上の高い特異性と精度を示した。培養を必要とせず、迅速な診断と適切な治療開始が求められる患者に対して、この手法は有望な選択肢となる。
英語
Objectives:
The genus Mycobacterium, including M. tuberculosis and over 200 NTM species, shows significant variability in clinical outcomes and drug susceptibility at species and subspecies levels. While culture-based identification is the gold standard, the slow growth of mycobacteria delays diagnosis and treatment. This study evaluated a novel culture-free method for subspecies-level identification of mycobacteria directly from sputum.
Methods:
This single-center prospective cohort study at Osaka Toneyama Medical Center analyzed 125 sputum samples from 115 patients with suspected or confirmed NTM pulmonary disease and 10 with non-NTM respiratory diseases. Samples were decontaminated using NALC-NaOH or succinic acid. Two workflows were compared: (1) the reference culture method involving mycobacterial culture and whole genome sequencing, and (2) direct target-capture sequencing as a culture-free method. Subspecies were identified using core genome MLST, covering over 380 mycobacterial species.
Results:
Among 115 NTM cases, 57 samples were smear-positive and 93 culture-positive. Identified subspecies included M. avium subsp. hominissuis (48), M. intracellulare subsp. intracellulare (22), subsp. chimaera (5), M. abscessus subsp. abscessus (7), subsp. massiliense (5), M. tuberculosis (1), and 5 others. The culture-free method identified subspecies in 75.4% of smear-positive samples (43/57) and 13.9% of smear-negative ones (5/36). NALC-NaOH pretreatment had higher accuracy (19/21, 90.5%) than succinic acid (24/36, 66.7%).
Conclusions:
The culture-free method showed high specificity and accuracy, especially in smear-positive, alkaline-treated sputum. It offers a promising alternative for rapid diagnosis and timely treatment, avoiding the delays of culture-based methods.
2025 | 年 | 06 | 月 | 09 | 日 |
2025 | 年 | 06 | 月 | 09 | 日 |
日本語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr/ctr_view.cgi?recptno=R000066443
英語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr_e/ctr_view.cgi?recptno=R000066443