UMIN試験ID | UMIN000051289 |
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受付番号 | R000058409 |
科学的試験名 | 胃液細菌叢解析における前処置薬が細菌叢プロファイルに与える影響 |
一般公開日(本登録希望日) | 2023/06/07 |
最終更新日 | 2025/06/07 11:45:53 |
日本語
胃液細菌叢解析における前処置薬が細菌叢プロファイルに与える影響
英語
Effect of endoscopic pretreatment drugs on the microbiota profile in gastric fluid microbiota analysis
日本語
前処置薬が胃液内細菌叢に与える影響
英語
Effect of pretreatment drugs on gastric fluid microflora
日本語
胃液細菌叢解析における前処置薬が細菌叢プロファイルに与える影響
英語
Effect of endoscopic pretreatment drugs on the microbiota profile in gastric fluid microbiota analysis
日本語
胃液細菌叢解析における前処置薬の影響
英語
Effect of pretreatment drugs on gastric fluid microbiota analysis
日本/Japan |
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健常者
英語
Healthy subjects
成人/Adult |
悪性腫瘍以外/Others
いいえ/NO
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メタ16S rRNA細菌叢解析において、各種内視鏡前処置薬が胃細菌叢解析結果に与える影響を調査すること。
英語
To investigate the effect of endoscopic pretreatment drugs on gastric microbiota analysis results in 16S rDNA sequencing
生物学的・臨床的同等性/Bio-equivalence
日本語
英語
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細菌叢プロファイル
英語
Microbial profiles based on 16S rDNA amplicon sequencing
日本語
英語
観察/Observational
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20 | 歳/years-old | 以上/<= |
適用なし/Not applicable |
男女両方/Male and Female
日本語
2017年4月1日から2019年3月31日までの間に研究課題名「消化器疾患における炎症・発癌・機能障害と細菌叢との関連性に関する研究」(UMIN000040192)に参加し唾液細菌叢解析を実施した被験者
英語
Subjects who participated in the study entitled "Association of gut microbiota with inflammation, cancer, or dysfunction in gastrointestinal diseases UMIN000040192" from April 1, 2017 to March 31, 2019, and underwent salivary microbiota analysis.
日本語
1) 内視鏡実施の際に、静脈麻酔+咽頭キシロカインスプレーに加えて、薬剤を事前に嚥下するタイプの前処置法(主にキシロカインビスカス・プロナーゼ・ガスコンドロップ)のいずれかを実施して内視鏡検査を行ったうえで胃液採取を行った者
2) オプトアウトにより参加拒否を申し出た者
英語
1) Those who performed endoscopy with either intravenous anesthesia plus pharyngeal Xylocaine spray plus one of the pre-treatment methods (mainly Xylocaine Viscose, Pronase, Gascon drop) in which the drug is swallowed beforehand, and then collected gastric juice at the time of the endoscopy
2) Those who refused to participate by opting out.
6
日本語
名 | 俊樹 |
ミドルネーム | |
姓 | 二口 |
英語
名 | Toshiki |
ミドルネーム | |
姓 | Futakuchi |
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東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
日本語
内視鏡医学講座
英語
Department of Endoscopy
105-8461
日本語
東京都港区西新橋3-25-8
英語
3-25-8, Nishi-shimbashi, Minato-ku Tokyo, Japan
0334331111
futakuchi.t@gmail.com
日本語
名 | 俊樹 |
ミドルネーム | |
姓 | 二口 |
英語
名 | Toshiki |
ミドルネーム | |
姓 | Futakuchi |
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東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
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内視鏡医学講座
英語
Department of Endoscopy
105-8461
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東京都港区西新橋3-25-8
英語
3-25-8, Nishi-shimbashi, Minato-ku Tokyo, Japan
0334331111
futakuchi.t@gmail.com
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東京慈恵会医科大学
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The Jikei University School of Medicine
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東京慈恵会医科大学
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The Jikei University School of Medicine
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自己調達/Self funding
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東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
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東京都港区西新橋3-25-8
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3-25-8, Nishi-shimbashi, Minato-ku Tokyo, Japan
0334331111
futakuchi.t@gmail.com
いいえ/NO
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英語
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2023 | 年 | 06 | 月 | 07 | 日 |
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jgh3.70141
最終結果が公表されている/Published
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jgh3.70141
6
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抽出されたゲノムDNA量は、6つのグループ間で有意な差は認められなかった。α多様性指標も、処理群間で有意差は認められなかった。
加えて、ジメチコン群、、プロナーゼ群およびそれらの混合群はtechnical replicatesと比較して、重み付きUniFrac距離で有意な差を示した(すべてp = 0.03)が、非重み付きUniFrac距離では有意差は観察されなかった。しかし、いくつかの細菌叢については、門および属レベルで相対的豊富度に有意な差が認められた。
英語
The total amount of extracted gDNA did not significantly differ between the six groups. The alfa-diversity indices did not significantly differ between treatment groups. Although GAS, PRO, and MIX differed significantly from the technical replicates in the weighted UniFrac distance (p = 0.03 all), no significant difference was observed in the unweighted UniFrac distance. However, significant differences were observed in the relative abundance of several bacterial microbiota at the phylum and genus levels.
2025 | 年 | 06 | 月 | 07 | 日 |
日本語
英語
日本語
2019年9月から10月の間に一志胃腸科クリニックを受診した6名の患者を本研究に登録した。
英語
Six patients, who visited the Isshi Gastrointestinal Clinic between September and October 2019, were recruited for this study.
日本語
すべての患者から、登録前に文書によるインフォームドコンセントを取得した。胃液サンプルは、少なくとも12時間の絶食後に内視鏡を用いて吸引し、Specimen Collection Containerを使用して採取した。採取された胃液が20 mL未満であった場合は、滅菌蒸留水を加えて全体で20 mLとした。
英語
All patients provided written informed consent to participate before being recruited. Gastric juice samples were aspirated with endoscopy from patients after fasting for at least 12 h and collected using Specimen Collection Containers (Cardinal Health K.K., Japan). If the collected gastric juice was less than 20 mL, sterile distilled water was added to make up a total volume of 20 mL.
日本語
なし
英語
N/A
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(1) ゲノムDNA量、(2) Shannon指数、OTU数、Chao1指数を用いたα多様性指標、(3) 重み付きおよび非重み付きUniFrac距離、(4) 門および属レベルでの相対的豊富度
英語
(1) amount of genomic DNA (gDNA), (2) alfa- diversity indices using the Shannon index, number of OTUs, and Chao1 index, (3) weighted and unweighted UniFrac distances, and (4) the relative abundance of phyla and genera.
日本語
英語
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英語
試験終了/Completed
2020 | 年 | 10 | 月 | 01 | 日 |
2020 | 年 | 12 | 月 | 07 | 日 |
2023 | 年 | 06 | 月 | 07 | 日 |
2023 | 年 | 12 | 月 | 07 | 日 |
日本語
本研究は、「消化器疾患における炎症・発癌・機能障害と細菌叢との関連性に関する研究(UMIN000040192)」において網羅的に行った回収検体を16s rRNAシークエンスのデータにて保存していた。IRB、UMIN登録後に後ろ向きに解析を行った。
英語
The study was conducted in the "Association of gut microbiota with inflammation, cancer, or dysfunction in gastrointestinal diseases (UMIN000040192)" in which exhaustive collection specimens were stored in 16s rRNA sequencing data.
Retrospective analysis was performed after IRB and UMIN registration.
2023 | 年 | 06 | 月 | 07 | 日 |
2025 | 年 | 06 | 月 | 07 | 日 |
日本語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr/ctr_view.cgi?recptno=R000058409
英語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr_e/ctr_view.cgi?recptno=R000058409