UMIN試験ID | UMIN000041359 |
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受付番号 | R000047220 |
科学的試験名 | 網羅的ゲノムDNA解析による病原体の同定に関する研究 |
一般公開日(本登録希望日) | 2020/08/08 |
最終更新日 | 2023/06/21 19:03:18 |
日本語
細菌のDNA検出による病原体の同定に関する研究
英語
Study on identification of pathogens by bacterial DNA detection
日本語
細菌検出方法に関する研究
英語
Study on bacteria detection method
日本語
網羅的ゲノムDNA解析による病原体の同定に関する研究
英語
Study on pathogen identification by comprehensive genomic DNA analysis
日本語
Tm mapping法
英語
Tm mapping method
日本/Japan |
日本語
感染症
英語
infectious disease
感染症内科学/Infectious disease | 小児科学/Pediatrics |
悪性腫瘍以外/Others
いいえ/NO
日本語
感染症患者において、病原体同定方法であるMelting Temperature mapping法(Tm mapping法)の有用性を検討する。
英語
The aim is to examine the usefulness of the Melting Temperature mapping (Tm mapping) analysis, which is a pathogen identification method, in patients with infectious diseases.
有効性/Efficacy
日本語
英語
検証的/Confirmatory
実務的/Pragmatic
該当せず/Not applicable
日本語
感染症患者におけるTm mapping法と血液培養検査と一致率
英語
Concordance rate with Tm mapping analysis and blood culture test in patients with infectious disease.
日本語
①Tm mapping法と血液マーカーとの関連、②病原体同定までの時間、③臨床経過と細菌DNAの残存時間
英語
1: Relationship between Tm mapping analysis and blood test values. 2: Time until pathogen identification. 3: Relationship between clinical course and remaining time of bacterial DNA
観察/Observational
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
日本語
英語
適用なし/Not applicable |
適用なし/Not applicable |
男女両方/Male and Female
日本語
①国立成育医療研究センターで細菌感染症と診断あるいは細菌感染症が疑われた患者を対象とする。
②Tm mapping実験を施行可能な時間にインフォームドコンセントで同意を得た患者
英語
1. Patients are diagnosed with bacterial infection or suspected of bacterial infection in the National Center for Child Health and Development.
2. written informed consent obtained at the appropriate time to conduct the TM experiment
日本語
①本研究によって、病状を著しく悪化させる基礎疾患・合併症が明らかな患者
②その他、担当医師が不適当と判断した患者
英語
1. Patients whose disease is significantly exacerbated by this study.
2. Other patients who the doctor judges as inappropriate.
100
日本語
名 | 河合 |
ミドルネーム | |
姓 | 利尚 |
英語
名 | Toshinao |
ミドルネーム | |
姓 | Kawai |
日本語
国立成育医療研究センター
英語
National Center for Child Health and Development
日本語
免疫科
英語
Division of Immunology
157-8535
日本語
東京都世田谷区大蔵2-10-1
英語
2-10-1 Okura,Setagaya-ku,tokyo,Japan
+81334160181
kawai-t@ncchd.go.jp
日本語
名 | 石川 |
ミドルネーム | |
姓 | 尊士 |
英語
名 | Takashi |
ミドルネーム | |
姓 | Ishikawa |
日本語
国立成育医療研究センター
英語
National Center for Child Health and Development
日本語
免疫科
英語
Division of Immunology
157-8535
日本語
東京世田谷区大蔵2-10-1
英語
2-10-1 Okura,Setagaya-ku,tokyo,Japan
+81334160181
ishikawa-ta@ncchd.go.jp
日本語
国立研究開発法人国立成育医療研究センター
英語
Division of Immunology, National Center for Child Health and Development
日本語
日本語
免疫科
日本語
英語
日本語
国立研究開発法人国立成育医療研究センター
英語
National Center for Child Health and Development
日本語
日本語
その他/Other
日本語
日本
英語
Japan
日本語
英語
日本語
英語
日本語
国立成育医療研究センター
英語
National Center for Child Health and Development
日本語
2-10-1 Okura,Setagaya-ku,tokyo,Japan
英語
2-10-1 Okura,Setagaya-ku,tokyo,Japan
+81334160181
rinri@ncchd.go.jp
いいえ/NO
日本語
英語
日本語
英語
2020 | 年 | 08 | 月 | 08 | 日 |
Registered
未公表/Unpublished
Registered
113
日本語
【16歳未満の解析データ】81人、93検体
Tm mapping陽性 23検体(血液培養と11検体が一致)
Tm mapping陰性 64検体(血液培養と62検体が一致)
陽性一致率 48%
陰性一致率 97%
Tm mappingでは判断困難な不適切検体が6検体あった。
英語
Showing data under 16. The median age of 81 patients (93 samples) was 3.6 years. Of 23 samples identified by TM, 11 samples matched the bacterial species with BC (positive-match rate, 48%). Of 64 TM-negative samples, 62 samples were negative for BC (negative-match rate, 97%). Six samples, including one containing two pathogenic bacterial species, were not suitable for TM identification. In total, the matched samples were 73 of 93 samples (match rate, 78%).
2021 | 年 | 02 | 月 | 08 | 日 |
日本語
英語
日本語
92人が登録された。年齢の中央値は4.1歳(IQR 1.8-12.3歳)であった。男性は78人(69%)。
背景疾患と免疫不全を起こす病態として、免疫不全症と診断された患者からが28検体(16%)、造血幹細胞移植もしくは臓器移植からが26検体(24%)、自己免疫疾患による免疫抑制剤投与中からが13検体(10%)、健常者からが16検体(15%)であった。
【16歳未満】
81人が登録された。年齢の中央値は3.6歳(IQR 1.0-7.4歳)であった。男性は57人(70%)。
英語
Ninety-two patients were enrolled.
Age, median (IQR) 4.1y (1.8-12.3)
Male, 78 (69%)
Background or underlying diseases, n (%)
Primary immunodeficiency 28 (16%)
Hematopoietic cell or organ transplantation 26 (24%)
Autoimmune disease 13 (10%)
None 46 (15%)
[Children under 16 years old]
Eighty-one patients were enrolled.
Age, median (IQR) 3.6y (1.0-7.4)
Male, 57 (70%)
Background or underlying diseases, n (%)
Primary immunodeficiency 16 (20%)
Hematopoietic cell or organ transplantation 19 (23%)
Autoimmune disease 8 (10%)
None 37 (47%)
日本語
92人が登録され、113検体が検査の対象となった。
【16歳未満】
81人が登録され、93検体が検査の対象となった。
英語
Inclusion criteria included suspected or diagnosed BSI, and obtaining written informed consent at the appropriate time to conduct the Tm mapping experiment. Exclusion criteria included any underlying disease or complication that could be significantly exacerbated by this study.
日本語
なし
英語
None
日本語
Tm mappingの同定時間は4.7 時間 (IQR, 4.6-5.1)であった。血液培養の陽性になるまでの時間は、好気性 12.1時間 (IQR, 9.4-16.9)、嫌気性 16.1時間 (IQR, 11.0-22.7)であった。
英語
The median inspection time to identification of Tm mapping methods in the 17 samples measured after the procedures were established was 4.7 hours (IQR, 4.6-5.1). On the other hand, the time to positivity of blood cultures was 12.1 hours (IQR, 9.4-16.9) in aerobic cultures and 16.1 hours (IQR, 11.0-22.7) in anaerobic cultures
日本語
観察研究のため、個別症例のデータ共有はしません。
英語
We don't share IPD for observational studies.
日本語
個別症例の詳細を希望する場合は、論文掲載後にCorresponding authorにご連絡ください。
英語
If you would like more information on IPD, please contact the corresponding author after the article has been published.
試験終了/Completed
2018 | 年 | 04 | 月 | 01 | 日 |
2017 | 年 | 11 | 月 | 14 | 日 |
2018 | 年 | 04 | 月 | 01 | 日 |
2021 | 年 | 03 | 月 | 31 | 日 |
2022 | 年 | 01 | 月 | 31 | 日 |
2022 | 年 | 01 | 月 | 31 | 日 |
2023 | 年 | 01 | 月 | 31 | 日 |
日本語
登録および観察期間は終了しました。
英語
The registration and observation period has ended.
2020 | 年 | 08 | 月 | 08 | 日 |
2023 | 年 | 06 | 月 | 21 | 日 |
日本語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr/ctr_view.cgi?recptno=R000047220
英語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr_e/ctr_view.cgi?recptno=R000047220
研究計画書 | |
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登録日時 | ファイル名 |
研究症例データ仕様書 | |
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登録日時 | ファイル名 |
研究症例データ | |
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登録日時 | ファイル名 |